Szczególnie istotne jest bezpieczeństwo jeśli chodzi o systemy CMS wykorzystywane w serwisach internetowych administracji publicznej, a także dużych firm, w przypadku których utrata cennych danych albo ich wyciek z serwisu internetowego poprzez system CMS byłyby bardzo dużym problemem. Bardzo istotne jest dbanie o bezpieczeństwo haseł, jakimi zabezpieczane są systemy CMS. Wiele tutaj zależy właśnie od ich użytkowników i przestrzeganych przez nich zasad, takich jak częste zmiany haseł i wykorzystywanych przez systemy CMS do aktualizacji stron www nie zapisywanie ich w dostępnych miejscach.
Jeśli chodzi o cechy, jakimi powinny charakteryzować się
bezpieczne systemy CMS
, ważne jest na przykład aby dany system CMS posiadał możliwość tworzenia kopii zapasowych danych, które mogłyby być zmienione przez nieuprawnionego użytkownika lub utracone przez przypadek, albo na skutek awarii jakiej uległ system do aktualizacji bądź serwera. Również bezawaryjność to cecha jaką powinien koniecznie charakteryzować się bezpieczny system do zarządzania stroną cms. Jeśli zależy nam na bezpieczeństwie naszego serwisu internetowego, warto zdecydować się na płatny system CMS, gdyż darmowe systemy CMS do aktualizacji stron www często posiadają luki wynikające z ich budowy (tworzone są przez zespoły programistów którymi ciężko aż tak efektywnie zarządzać) i które stawiają przed sobą przede wszystkim cele dotyczące ich funkcjonalności.